31 março 2016

DuckeWiki em construção

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Novo sistema de informação dedicado à gestão de dados sobre a diversidade de plantas e fungos na Amazônia irá facilitar a geração e popularização de conhecimento biológico na região. O DuckeWiki está sendo construído em software livre e terá bastante flexibilidade para ser adaptado a diferentes necessidades.

Alberto Vicentini coletando informações sobre plantas usando um formulário ODK em um celular android.

O desafio de se investigar a diversidade de plantas e fungos na Amazônia é imenso. Além de abrigar muitas espécies, a escassa quantidade de recursos humanos dedicados a estudar esses organismos fica ainda mais rarefeita quando se considera a extensão geográfica continental da Amazônia, resultando em uma baixa densidade de amostras e contribuindo para a instabilidade na delimitação das espécies e no avanço sobre a compreensão de sua biodiversidade. Porém, acredita-se que mudanças estruturais em alguns procedimentos cotidianos da prática botânica e micológica podem promover melhorias significativas no processo de produção de conhecimento.

Dr. Adolpho Ducke e subidor preparando espécimes botânicos em Utinga, próximo a Belém em 1943.
[fonte: Taxon 11:234]

Criado por iniciativa do Dr. Alberto Vicentini do INPA, o DuckeWiki é uma plataforma virtual planejada para modernizar a geração de conhecimento sobre a flora e a micota da Amazônia, permitindo armazenar, compartilhar, analisar e disponibilizar informações sobre plantas e fungos com o objetivo de acelerar e popularizar a produção desse conhecimento. O nome DuckeWiki foi composto em homenagem ao Dr. Adolpho Ducke, um dos maiores botânicos da Amazônia, e ao dokuwiki (www.dokuwiki.org), uma plataforma wiki inspiradora.

Formulário de entrada de dados de uma amostra coletada, incluindo informações básicas e links para outros formulários (notas, habitat e taxonomia).

"A maneira como ainda fazemos ciência, sem integração de dados em um ou mais sistemas de informação, reduz a capacidade de gerar conhecimento principalmente por sobrepor esforços e induzir a necessidade de se retrabalhar as amostras a cada novo estudo", sustenta Vicentini. O processo de investigação e compreensão sobre a biodiversidade se inicia com a coleta de amostras e dados sobre os organismos que servem como base para a circunscrição e nomeação de espécies. Em seguida, a demanda é pela identificação de amostras, sejam amostras férteis ou estéreis. Entretanto, existe uma grande assimetria entre o volume de amostras que geram conhecimento e o volume de amostras para ser identificado, este último muito maior. Segundo o pesquisador, a existência de boas ferramentas para identificar espécies e integrar variação ao nível das amostras contribuirá para reduzir essa assimetria.

Interface da versão antiga mostrando a aba de especímenes que resume as informações inseridas no sistema.

Reunidos para avaliar o funcionamento do sistema, o pesquisador e alunos de pós-doc, doutorado e mestrado da pós-graduação em Botânica discutiram a estrutura e o funcionamento da versão 1.0 beta que vem sendo construída por ele ao longo dos últimos anos. O sistema permite a inclusão de dados de coletas, de monitoramento, dados secundários derivados da literatura, dados de localidades onde as amostras foram coletadas e dados relacionados a nomes científicos com distinção entre nomes publicados e nomes não publicados, oferecendo grande flexibilidade para criar variáveis. A interface permite a visualização de dados de forma resumida, incluindo opções de busca, filtragem, importação e exportação de dados. Por fim, a preservação dos dados é feita na nuvem, o que facilita o desenvolvimento de trabalhos em rede e contribui para a modernização da taxonomia.

A ideia é que o DuckeWiki seja modular, podendo ser adaptado segundo a demanda dos usuários. Módulos iniciais para a inclusão de dados moleculares, espectrais, bibliográficos e visuais já estão em funcionamento e uma série de funções estão em desenvolvimento, como a criação de guias interativos, chaves de identificação de múltiplo acesso e a integração com formulários para coleta de dados em celulares e tablets com sistema operacional android. O DuckeWiki está sendo aprimorado pelo programador Rodrigo Dias e a nova versão deverá ser lançada no segundo semestre de 2016.


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