PARA BAIXAR A POSTAGEM COMPLETA COM O TUTORIAL, SIGA A INSTRUÇÃO ABAIXO:
PARA REPRODUZIR A POSTAGEM EM SEU COMPUTADOR, BAIXE o arquivo .Rmd juntamente com todos os dados necessários para gerar o mapa reproduzido no fim desta postagem NESTE LINK, procure o arquivo de extensão “.Rmd” e abra-o em seu computador, preferencialmente usando o RStudio. Execute o arquivo usando a função
Preview presente no RStudio, certificando-se de que você tenha os pacotes knitr, rmarkdown e todas as dependências devidamente instaladas em seu computador.
Esta postagem foi construída usando o formato R Notebook. Visite os links ao fim desta postagem para obter mais informações sobre este formato e seus benefícios para a reprodutibilidade na Ciência.
O tutorial é bem simples e visa a produção de um mapa de distribuição geográfica utilizando dados que abrangem a distribuição espacial de duas espécies de Burseraceae, Protium aracouchini (Aubl.) Marchand e P. heptaphyllum (Aubl.) Marchand. A primeira planta faz parte de um complexo de espécies informalmente denominado complexo Protium aracouchini, cuja sistemática e taxonomia vem sendo objeto de estudo em meu doutorado. A segunda espécie, P. heptaphyllum, é objeto de estudo de Gabriel Damasco, colaborador do LABOTAM e aluno de doutorado na Universidade da Califórnia, Berkeley.
Os dados foram baixados do herbário virtual do Jardim Botânico de Nova Iorque que é onde trabalha o especialista em Burseraceae, Dr. Douglas Daly, e cuja coleção de espécimes e dados vêm sendo bem cuidada há algumas décadas. Para esta postagem, filtramos apenas os dados para as duas espécies citadas acima.
Dúvidas, sugestões, erros no script, favor entrar em contato comigo, via comentários, ou por email.
Esta postagem completa, incluindo os blocos de código, pode ser lida inteiramente neste link. Lá você pode copiar o arquivo bruto para o seu computador e modificá-lo à vontade.
Divirta-se!!!
